參加當年亞洲冠軍聯賽的兩支球隊小組賽輪空，直接晉級日本聯賽盃八強，其余J1聯賽的16支球隊被分成4個小組進行主客場雙循環比賽，最後按積分高低排名，若積分相同則依次以淨勝球、進球數和勝負關係決定排名，4個小組第一名和2個成績最好的小組第二名晉級八強；八強和半決賽采取兩回合主客場淘汰制，如果兩回合總計入球數相同則計算客場入球，若仍未能分出勝負則須加時再決勝負，倘若加時賽打平則以互射點球分勝負；決賽於中立場進行，90分鍾打平進行加時直至點球決出冠軍。